Søen ligger i bunden af en dal, som i løbet af istiden blev formet som en tunneldal. Søbygård Sø har forbindelse til området ved Granslev Å og har Gudenåsystemet som samlende element. Søen er en lille meget lavvandet sø på 40 hektar med en middeldybde på 1 meter. Søen har tilløb fra Møllebækken (mod øst) og afløb til Gudenåen via Gjern Å (mod vest). Meget af søen er omkranset af skov (Sall Skov på nordsiden og Søbygård Skov på sydsiden) – særlig bemærkelsesværdig er de mange asketræer i Sall skov. Ask lukker ikke bunden nær så tæt som eksempelvis bøg, hvilket giver en del lys til planterne på skovbunden.
Der er adgang ad stier og markveje – man kan godt gå de 4-5 km rundt om søen, men ruten er ikke markeret, og det kan måske være lidt svært at finde vejen rundt. Nemmest er det at se området fra sydsiden ved Søbygårdsvej i Søbylunde. Man kan så gå mod øst af en sti gennem skoven. Her får man et godt kig ud over søen. Området er privatejet.